MRI HIFU dựa trên nguyên lý cơ bản tập trung năng lượng sóng siêu âm cường độ cao dưới định vị của máy cộng hưởng từ một cách chính xác vào khối u từ đó làm tăng nhiệt độ nội tại của khối u khiến cho khối u bị chết. Phần mô u bị chết này sẽ được cơ thể hấp thu bằng con đường thực bào tự nhiên [6][7][8].